Projekt Nevropsihološki dejavniki samomorilnosti pri osebah, odvisnih od alkohola Trajanje projekta: 1. julij 2002–30. junij 2005 Vodja projekta: dr. Lilijana Šprah Šifra: L3―4184
Projekt Razvoj kakovosti in dostopnosti preventivne zdravstvene dejavnosti na področju duševnega zdravja na primarnem nivoju Trajanje projekta: 1. oktober 2006–30. september 2008 Vodja projekta: dr. Mojca Zvezdana Dernovšek Šifra: V3―0370
Projekt Potrebe priseljenk in njihovo vključevanje v ostarelo družbo Trajanje projekta: 1. januar 2006–31. december 2007 Vodja projekta: dr. Charlote Höhn Šifra: SSP4-CT-2005-022355
Projekt Z znanjem do zdravja zaposlenih Trajanje projekta: 1. oktober 2013–1. november 2014 Vodja projekta: Vladimir Tkalec
Projekt Skrb za zdravje zaposlenih skozi usmerjeno obvladovanje psihosocialnih obremenitev Trajanje projekta: 15. september 2013–15. november 2014 Vodja projekta: dr. Lilijana Šprah
Projekt Standardizirano elektronsko kodiranje in mapiranje služb za dolgotrajno oskrbo Trajanje projekta: 1. julij 2008–31. januar 2011 Vodja projekta: dr. Luis Salvador Carulla
Projekt Analiza tveganj za razvoj težav v duševnem zdravju prebivalcev Republike Slovenije v posameznih statističnih regijah s pomočjo prilagojene metodologije OECD Indeksa boljšega življenja Trajanje projekta: 15. september 2011–15. november 2011 Vodja projekta: dr. Lilijana Šprah
Projekt Izzivi in potrebe v prenosu znanja v kmetijsko prakso v Sloveniji Trajanje projekta: 1. oktober 2010–30. september 2012 Vodja projekta: dr. Majda Černič Istenič Šifra: V4-1061 (B)
Projekt Življenje z motnjo razpoloženja: Izobraževalni program prepoznavanja in obvladovanja bipolarne in depresivne motnje razpoloženja Trajanje projekta: 22. september 2011–15. november 2012 Vodja projekta: dr. Lilijana Šprah